Jedním z nejnavštěvovanějších muzeí v Puerto Iguazu je "Museo Imagenes de la Selva“, které představuje rozsáhlou sbírku dřevěných soch a nabízí pohled do místní kultury a prostředí deštného pralesa. Dalším pozoruhodným muzeem je "Guira Oga“, což je spíše ptačí rehabilitační centrum, kde se návštěvníci mohou dozvědět o ochranářských snahách v této oblasti. "La Aripuca“ je také oblíbenou ekokulturní atrakcí, i když nejde o tradiční muzeum, nabízí rozsáhlé repliky domorodých pastí a nabízí pohled do místní kultury Guaraní.
