San Sebastian se může pochlubit řadou muzeí, která se zabývají různými zájmy. San Telmo Museoa, které se nachází na úpatí hory Urgull, je oblíbené se zaměřením na baskickou kulturu a historii. Pro milovníky současného umění nabízí Mezinárodní centrum současné kultury Tabakalera dynamickou škálu výstav a akcí. Akvárium, jedno z nejstarších ve Španělsku, poskytuje poutavý zážitek z mořského života a oceánografické historie. Konečně, Eureka! Science Museum zapojuje návštěvníky všech věkových kategorií interaktivními vědeckými exponáty.
