Lisabona piedāvā dažādus muzejus, kas rūpējas par dažādām interesēm. Daži muzeji, kas noteikti jāapmeklē, ietver Calouste Gulbenkian muzeju, kas pazīstams ar savu daudzveidīgo kolekciju, sākot no senās Ēģiptes artefaktiem līdz mūsdienu Eiropas mākslai; Nacionālais flīžu muzejs (Museu Nacional do Azulejo), kas demonstrē tradicionālās portugāļu flīžu mākslu un vēsturi; Berardo kolekcijas muzejs, kas piedāvā moderno un laikmetīgo mākslu; un MAAT (Mākslas, arhitektūras un tehnoloģiju muzejs) tiem, kurus interesē mūsdienu māksla, arhitektūra un tehnoloģijas. Unikāls ir arī Autobusu muzejs (Museu Nacional dos Coches), kurā ir apskatāma plaša vēsturisko vagonu kolekcija.
