São Paulo má svoj podiel na jedinečných a neobvyklých múzeách, ktoré uspokojujú špecializované záujmy. Museu do Futebol (Futbalové múzeum) odráža vášeň mesta pre futbal a ponúka interaktívnu cestu históriou brazílskeho futbalu. Pre tých, ktorí sa zaujímajú o špecializovanejšie témy, Catavento Cultural e Educacional ponúka praktické vedecké ukážky a Instituto Butantan ponúka biologickú zbierku, ktorá zahŕňa hady, pavúky a škorpióny. Pre zameranie sa na modernejšiu zvedavosť poskytuje Museu da Imaginação interaktívny priestor, kde môžu deti skúmať umenie a invenčnú hru.
